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          生物培训班 培训班详情

          2016年创富彩票平台信息分析培训班——多样性&转录组&简化基因组

          开课时间:2016年07月25日—2016年09月09日
          ¥3000
          报名截止日期:
          课程介绍 课程表

          主办单位:创富彩票-创富彩票|平台

          开课时间:2016年7月25-8月26号

          开课地点:创富彩票平台上海总部:上海市浦东新区康新公路3399弄时代医创园3号楼

           

          培训特色

                根据老师们需求针对性的开设“入门班”、“进阶班”。

                小班教学,1对1专人指导,保证教学效果。

                讲师拥有丰富的数据分析和软件研发经验。

                主题明确,针对性强。理论与实践结合,针对专题内容进行深入讲解。

                精心挑选上机软件,实用性强,方便学员课下独立操作。

          收费标准

               “入门班”3000/人,含学费、资料费、培训期间午餐费;

               “进阶班”4000/人,含学费、资料费、培训期间午餐费。

                 培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理。

          优惠政策

                学生执学生证享受9折优惠。

          报名方式

                 联系当地销售

                 点击下载下方报名回执表,发送至邮箱jia.yu@saferoutesne.com

          付费方式

                 现金、支票、转账汇款

                 账户信息

                 名 称:创富彩票-创富彩票|平台

                 开户行:浦发银行张江科技支行

                 账 号:97160154740003720

                 名 称:上海桑格信息技术有限公司

                 开户行:浦发银行张江科技支行

                 账 号:97160154740009921

          报到注册

          报到时间:

                 多样性入门班2016年7月24日,多样性进阶班2016年7月31日,

                 转录组入门班2016年8月7日,转录组进阶班2016年8月14日,

                 简化基因组班2016年8月21日

          报到地点:上海市浦东新区康新公路3399弄时代医创园3号楼

          联系方式

                 联系人:余老师

                 咨询电话:021-51875086-8157,15901949102

                 E-mail:jia.yu@saferoutesne.com

                 报名截止:本次培训名额有限,报名截止日期

                 2016年7月20日(多样性入门班) 2016年7月27日(多样性进阶班) 

                 2016年8月3日(转录组入门班)  2016年8月10日(转录组进阶班)

                 2016年8月17日(简化基因组)

          报名回执表下载

          多样性入门班

          日期

          时间

          课程

          授课内容

          7.25

          08:30-11:30

          Linux入门及基础操作

          Linux介绍,常用命令使用、文本编辑器等

          13:00-17:00

          R语言基础及作图

          R软件及R package安装,数据类型,基础语法,常用数据处理方法,常用绘图命令、绘图参数使用等

          18:00

          晚宴

          7.26

          08:30-11:30

          微生物多样性研究概要

          多样性研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读

          13:00-17:00

          微生物多样性基础分析

          常用分析软件及数据库介绍、序列质控、OTU聚类与物种分类、α多样性分析等

          7.27

          08:30-11:30

          微生物多样性标准分析

          相关package安装,群落组成柱图,heatmap图,venn图分析等的实现

          13:00-17:00

          微生物多样性标准分析·续

          宏基因组研究概要

          相似度聚类树、PCA/PCoA分析及RDA/CCA分析等的实现

          宏基因组研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读等

          7.28

          08:30-11:30

          宏基因组分析

          宏基因组分析流程和常用工具介绍

          13:00-17:00

          课程回顾、总结、答疑

          适用于:

                    具备微生物多样性分析基本理论知识;

                    Linux系统或R语言零基础或薄弱基础;

                    注: 有一定编程经验更佳!       

           

          多样性进阶班

          日期

          时间

          课程

          授课内容

          8.1

          08:30-11:30

          微生物多样性研究概要

          多样性研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读

          13:00-17:00

          微生物多样性基础分析

          常用分析软件及数据库介绍、OTU聚类与物种分类、α多样性分析等的算法、原理和实现

          18:00

          晚宴

          8.2

          08:30-11:30

          R语言数据处理与绘图

          数据采集,数据清洗,常规数据运算,常用R包介绍(ggplot2等),常用统计函数等

          13:00-17:00

          R语言数据处理与绘图

          数据采集,数据清洗,常规数据运算,常用R包介绍(ggplot2等),常用统计函数等

          8.3

          08:30-11:30

          微生物多样性标准分析

          群落组成分析(柱图,heatmap图),群落比较分析(venn图),相似度聚类树及组合heatmap图等的算法、原理、参数调整和结果优化

          13:00-17:00

          微生物多样性高级分析

          排序分析(PCA/PCoA分析,NMDS分析及RDA/CCA分析),stamp分析,cytoscape分析等的算法、原理、参数调整和结果优化

          8.4

          08:30-11:30

          宏基因组研究概要

          包括研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读等

          13:00-17:00

          宏基因组分析

          宏基因组分析流程和常用工具介绍

          8.5

          08:30-11:30

          宏转录组研究概要

          包括研究进展及应用、研究思路、经典案例、方案设计、结果解读等

          13:00-17:00

          宏转录组分析思路;

          课程回顾、总结、答疑

          宏转录组分析思路和常用工具介绍

          适用于:

                  具备微生物多样性分析基本理论知识;

                  熟练使用Linux系统进行日常操作(查看,编辑,复制,删除,压缩,执行软件等);

                  会使用R语言进行简单数据分析(了解数据类型,基础语法,文件读写,简单绘图命令等);

                  有一定编程经验(了解数据类型,变量,表达式,循环,选择等)。

           

          转录组入门班

          日期

          时间

          课程

          授课内容

          8.8

          08:30-11:30

          转录组研究概述

          第二代、三代测序技术介绍,转录组测序基本概念、实验原理及应用综述,普通转录组、互作转录组、比较转录组、全长转录组、单细胞转录组等。

          13:00-17:00

          linux操作系统入门

          Linux软件安装,基本命令介绍,包括cp、mv、rm、mkdir、nano、wc等命令。

          18:00

          晚宴

          8.9

          08:30-11:30

          生物信息分析常用数据库及在线分析软件介绍

          常用数据库的介绍及常用在线分析软件的,包括NCBI、UCSC、ensembl、mirbase、rfam、NONCODE、blast、DAVID、PlantTFdb等。

          13:00-17:00

          R语言绘图入门

          R语言数据处理以及基础绘图介绍。

          8.10

          08:30-11:30

          mRNA研究应用及结果解读

          转录组mRNA研究基本概念,研究思路、研究案例,有参/无参转录组、真核/原核转录组、链特异性转录组,相关分析结果解读。

          13:00-17:00

          mRNA分析实操

          mRNA分析原理、分析流程介绍及重点分析步骤的实际操作演练,包括质控、组装、比对、差异表达分析、富集分析等。

          8.11

          08:30-11:30

          ncRNA基础知识及研究进展

          ncRNA概念,miRNA、lncRNA、circRNA概念及基本知识,研究进展、研究应用、研究案例,相关分析结果解读。

          13:00-17:00

          ncRNA分析实操

          ncRNA分析原理、分析流程介绍及重点分析步骤的实际操作演练,包括microRNA质控、microRNA/lncRNA/circRNA预测、靶基因预测、ncRNA家族预测等。

          8.12

          08:30-11:30

          转录组关联及高级分析

          RNA-RNA研究思路,microRNA、mRNA、lncRNA关联分析、分析原理、研究案例,转录组高级/个性化分析介绍。

          13:00-17:00

          课程回顾及总结

          课程回顾及总结,包括答疑、问卷调查等。

           

          转录组进阶班

          日期

          时间

          课程

          授课内容

          8.15

          08:30-11:30

          常用数据格式介绍

          主要讲解生物信息分析常用的数据格式,主要包括fasta、fastq、gtf/gff、bed、vcf、sam/bam等。

          13:00-17:00

          linux操作系统进阶

          主要讲解比较复杂的linux操作命令(sed、awk、grep、vi等)及shell编程。

          18:00

          晚宴

          8.16

          08:30-11:30

          perl编程语言入门

          主要讲解perl的基本语法、常用的数据结构。

          13:00-17:00

          perl编程语言进阶

          主讲讲解perl复杂数据结构及其在转录组分析中的应用案例。

          8.17

          08:30-11:30

          python编程语言入门

          主要讲解python语法基础。

          13:00-17:00

          python编程语言入门

          主要讲解python数据处理及在转录组分析中的应用实例。

          8.18

          08:30-11:30

          生物信息分析高级软件实操

          高级分析软件的基础知识介绍,包括IGV、Cytoscape、WGCNA、AI、primer等。

          13:00-17:00

          生物信息分析高级软件实操

          高级分析软件的实际操作,包括IGV、Cytoscape、WGCNA、AI、primer等。

          8.19

          08:30-11:30

          高级绘图

          复杂数据处理以及高级绘图介绍,包括circos图、有向无环图、ggplot等。

          13:00-17:00

          课程回顾及总结

          课程回顾及总结,包括答疑、问卷调查等。

           

          简化基因组

          日期

          时间

          课程

          8.22

          9:00-10:30

          高通量测序的数量遗传方案

          10:30-12:00

          简化基因组分析基本原理

          13:00-17:00

          简化基因组测序实操

          8.23

          9:00-11:00

          遗传图谱基本原理

          11:00-12:00

          JoinMap相关排图软件

          13:00-17:00

          Rqtl实操、MapQTL,WinQTLcart

          8.24

          9:00-10:30

          BSA

          9:00-10:30

          遗传群体方案设计

          13:00-17:00

          BSA实操

          8.25

          9:00-10:30

          群体多样性

          10:30-12:00

          PCA

          13:00-17:00

          群体结构、进化树

          8.26

          9:00-10:30

          GWAS与选择性清除

          10:30-12:00

          选择性清除

          13:00-16:00

          GWAS

          16:00-17:00

          群体遗传学方案设计

          说明

                以上课程内容可能会有微调,具体课程信息以实际上课为准。

               上机课程需学员自己携带笔记本电脑。

           

          2016年创富彩票平台信息分析培训班——多样性&转录组&简化基因组

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          联系地址

          发票信息
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          发票抬头

          住宿信息
          是否需要住宿
          入住时间

          酒店标准

          住宿费用
          报名申请

          报名疑问咨询:021-51875086

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